GCACU----CC--A
CU----CC--AGC
U----CC--AGCC
CUC----UGUA
GUACUCA
A--GCUGC--U
CUGC--UUA
U-UUUUGA
CACU----CC--A
C--AGCCUC
CACU CC AGCCUC UGUACUCA UC UAA GCUGC UUAU UUUUG
.........1411......1421...............1431......1441.......................1451............1461..........1471.............1481.........1491.........1501.......1511.......1521.......1531......
UUCCCU---CUAAACUGGGAGAA---------UAUCACAGUGGUUUUUGUU--------------AGCAG-AA--AAUGCACU----CC--AGCCUC----UGUACUCA---UC--UAA--GCUGC--UUAU-UUUUGA-UA--UUUGU-GUCAGUCUGUAAA-UGGAUACUUCACUUUA-AUAAC
TT AGCAG AA AATGCACT CC AGCCTC TG 1
AA AATGCACT CC AGCCTC TGTACTCA TC TA 1
CACT CC AGCCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CACT CC AGCCTC TGTACT 1
CACT CC AGCCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 2
ACT CC AGCCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTC 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 4
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 3
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTA 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CCTC TGTACTCA TC TAA G 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTA 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
CCTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CTC TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 2
C TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
C TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
C TGTACTCA TC TAA GCTGC TT 2
TGTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
CTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
CTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
GTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 3
CTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
CTACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 2 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 6
TACTCA TC TAA GCTGC TT 6
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 14
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 51
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 5
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT 16
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 13
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 8
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 6
TACTCA AC TAA GCTGC TTAT TTTT 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 10
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 22
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 9
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTA 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTT 22
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 6
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 6
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 26
TACTCA TC TAA GCTG 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTG 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTA 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 16
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 4
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 4
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT 4
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTG 3
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 10
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 5 7
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 1
TACTCA TC TAA GCTGC GTAT TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 3
TACTCA TC TGA GCTGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTG 1
TACACA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GATGC TTAT TTTT 1
TACTCA AC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC T 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTA 2
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTAG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TAAT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT ATTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 2
TACTCA TC TAC GCTGC TTAT TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 1
TACTCA TC TAT GCTGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TAG GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAT GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAT GCTGC TTAT TTTT 1
TACTCA TC TAA GATGC T 1
TACTCA TC GAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GCTAC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GATGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TAAT TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC T 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TGT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TAT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTGA TA TT 1
TACTAA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
TACACA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TCA GCTGC 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTGT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 69
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
TACTCA TC TCA GCTGC TT 1
TACTCA TC TAA TCTGC TTAT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTGA 1
TACTCC TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTTT TTT 1
TACTCA TC TAG GCTGC TTAT TTT 1
TACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
ACTCC TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 22
ACTCA TC TAG GCTGC TTAT TTTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTC 1
TCTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTA 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 36
ACTCA TC TAA GCTGC TTAA TT 1
GCTCA TC TAA GCTGC TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TATT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC T 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 6
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTG 4
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TGTTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
ACTCA TC TAG GCTGC TTAT TTTTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTA 1
ACTCA TC TAA GCTGC ATAT TTT 1
ACTCA TC TAC GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTTC TTAT TTT 1
ACTCA TC TGA GCTGC T 1
ACTCA TC TAC GCTGC TTAT TTTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC GTAT TTT 1
ACTCA TC TAC GCTGC TTAT T 1
ACTCA TC TAA GCTTC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 5
ACTCA TC TAA CCTGC TTAT TTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTT 2
ACACA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 2
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTA 2
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT T 2
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 2
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 2
ACTCA TC TAA GCTGC TT 1
ACTCA TC TAA TCTGC TTAT TTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT 1
ACTCA GC TAA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTA 3
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1
ACGCA TC TAA GCTGC TTAT T 1
ACTCA TC TAA ACTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 3
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 3
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 7
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 3
ACTCG TC TAA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 7
ACTCA TC TTA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTTT 9
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 3
ACTCA TC TAA GCTGC TT 3
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 1 3
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 8
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 8
ACTCG TC TAA GCTGC TTAT TT 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 4
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 21
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 10
ACTCA TC TAA GCTGC TTT 11
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 13
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 11
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT T 6
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1 1
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 4
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 31
ACTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 8
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 2
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CTCA TC TAA GCTGC TTTT T 1
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CTCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
ATCA TC TAA GCTGC TTAT 1
TCA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTT 2
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 2
TCA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CA TC TAA GCTGC TTTT 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTT 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TT 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 4
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 2
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTG 2
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTA 1
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 2
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTT 6
CT TC TAA GCTGC TTAT TTTT 2
CA TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 5
A TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
A TC TAA GCTGC TTTT TT 1
A TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
A TC TAA GCTGC TTAT TTTT 1
A TC TAA GCTGC TTAT TTTTG 5
AC TAA GCTGC TTAT TTT 1
TC TAA GCTGC ATAT TTT 1
C TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
C TAA GCTGC TTAT TTT 1
C TAA GCTGC TTAT TTTTG 1
C TAA GCTGC TTAT TTT 1
TAA GCTGC TTAT TTTTG 2
| miRNA Name | seed match | mirna start | mirna end | 3' pairing contribution | local AU contribution | position contribution | TA contribution | SPS contribution | context+ score | context+ score percentile |
| miRNA Name | seed_match | mirna start | mirna end | 3' pairing contribution | local AU contribution | position contribution | TA contribution | SPS contribution | context+ score | context+ score percentile |
| hsa-miR-4797-5p | 1 | 1464 | 1470 | NULL | NULL | NULL | -0.002 | 59 | -0.010 | 52 |
| hsa-miR-646 | 2 | 1479 | 1485 | NULL | NULL | NULL | -0.082 | 82 | -0.371 | 98 |
| hsa-miR-3613-3p | 1 | 1488 | 1494 | NULL | NULL | NULL | -0.026 | 78 | -0.110 | 92 |
| hsa-miR-485-5p | 2 | 1460 | 1466 | NULL | NULL | NULL | -0.043 | 63 | -0.186 | 87 |
| hsa-miR-6884-5p | 2 | 1460 | 1466 | NULL | NULL | NULL | -0.043 | 62 | -0.186 | 86 |
| hsa-miR-1911-5p | 1 | 1468 | 1474 | NULL | NULL | NULL | -0.031 | 51 | -0.131 | 75 |
| hsa-miR-3135b | 2 | 1457 | 1463 | NULL | NULL | NULL | -0.036 | 70 | -0.156 | 90 |
| hsa-miR-504-3p | 3 | 1454 | 1461 | NULL | NULL | NULL | -0.073 | 82 | -0.325 | 97 |
| hsa-miR-122-5p | 1 | 1455 | 1461 | NULL | NULL | NULL | -0.017 | 55 | -0.070 | 72 |
| hsa-miR-3652 | 2 | 1458 | 1464 | NULL | NULL | NULL | -0.038 | 63 | -0.162 | 88 |
| hsa-miR-4430 | 2 | 1458 | 1464 | NULL | NULL | NULL | -0.039 | 63 | -0.166 | 90 |
| hsa-miR-6792-5p | 2 | 1481 | 1487 | NULL | NULL | NULL | -0.043 | 79 | -0.185 | 95 |