Gene Symbol |
XIAP
|
Synonyms |
API3, BIRC4, IAP-3, ILP1, MIHA, XLP2, hIAP-3, hIAP3 |
Description |
X-linked inhibitor of apoptosis |
Transcript |
NM_001167
|
Expression |
|
Putative miRNA Targets on XIAP |
|
3'UTR of XIAP (miRNA target sites are highlighted) |
>XIAP|NM_001167|3'UTR
1 TCTAACTCTATAGTAGGCATGTTATGTTGTTCTTATTACCCTGATTGAATGTGTGATGTGAACTGACTTTAAGTAATCAG
81 GATTGAATTCCATTAGCATTTGCTACCAAGTAGGAAAAAAAATGTACATGGCAGTGTTTTAGTTGGCAATATAATCTTTG
161 AATTTCTTGATTTTTCAGGGTATTAGCTGTATTATCCATTTTTTTTACTGTTATTTAATTGAAACCATAGACTAAGAATA
241 AGAAGCATCATACTATAACTGAACACAATGTGTATTCATAGTATACTGATTTAATTTCTAAGTGTAAGTGAATTAATCAT
321 CTGGATTTTTTATTCTTTTCAGATAGGCTTAACAAATGGAGCTTTCTGTATATAAATGTGGAGATTAGAGTTAATCTCCC
401 CAATCACATAATTTGTTTTGTGTGAAAAAGGAATAAATTGTTCCATGCTGGTGGAAAGATAGAGATTGTTTTTAGAGGTT
481 GGTTGTTGTGTTTTAGGATTCTGTCCATTTTCTTTTAAAGTTATAAACACGTACTTGTGCGAATTATTTTTTTAAAGTGA
561 TTTGCCATTTTTGAAAGCGTATTTAATGATAGAATACTATCGAGCCAACATGTACTGACATGGAAAGATGTCAAAGATAT
641 GTTAAGTGTAAAATGCAAGTGGCAAAACACTATGTATAGTCTGAGCCAGATCAAAGTATGTATGTTTTTAATATGCATAG
721 AACAAAAGATTTGGAAAGATATACACCAAACTGTTAAATGTGGTTTCTCTTCGGGGAGGGGGGGATTGGGGGAGGGGCCC
801 CAGAGGGGTTTTATAGGGGCCTTTTCACTTTCTACTTTTTTCATTTTGTTCTGTTCGAATTTTTTATAAGTATGTATTAC
881 TTTTGTAATCAGAATTTTTAGAAAGTATTTTGCTGATTTAAAGGCTTAGGCATGTTCAAACGCCTGCAAAACTACTTATC
961 ACTCAGCTTTAGTTTTTCTAATCCAAGAAGGCAGGGCAGTTAACCTTTTTGGTGCCAATGTGAAATGTAAATGATTTTAT
1041 GTTTTTCCTGCTTTGTGGATGAAAAATATTTCTGAGTGGTAGTTTTTTGACAGGTAGACCATGTCTTATCTTGTTTCAAA
1121 ATAAGTATTTCTGATTTTGTAAAATGAAATATAAAATATGTCTCAGATCTTCCAATTAATTAGTAAGGATTCATCCTTAA
1201 TCCTTGCTAGTTTAAGCCTGCCTAAGTCACTTTACTAAAAGATCTTTGTTAACTCAGTATTTTAAACATCTGTCAGCTTA
1281 TGTAGGTAAAAGTAGAAGCATGTTTGTACACTGCTTGTAGTTATAGTGACAGCTTTCCATGTTGAGATTCTCATATCATC
1361 TTGTATCTTAAAGTTTCATGTGAGTTTTTACCGTTAGGATGATTAAGATGTATATAGGACAAAATGTTAAGTCTTTCCTC
1441 TACCTACATTTGTTTTCTTGGCTAGTAATAGTAGTAGATACTTCTGAAATAAATGTTCTCTCAAGATCCTTAAAACCTCT
1521 TGGAAATTATAAAAATATTGGCAAGAAAAGAAGAATAGTTGTTTAAATATTTTTTAAAAAACACTTGAATAAGAATCAGT
1601 AGGGTATAAACTAGAAGTTTAAAAATGCTTCATAGAACGTCCAGGGTTTACATTACAAGATTCTCACAACAAACCTATTG
1681 TAGAGGTGAGTAAGGCATGTTACTACAGAGGAAAGTTTGAGAGTAAAACTGTAAAAAATTATATTTTTGTTGTACTTTCT
1761 AAGAGAAAGAGTATTGTTATGTTCTCCTAACTTCTGTTGATTACTACTTTAAGTGATATTCATTTAAAACATTGCAAATT
1841 TATTTTATTTATTTAATTTTCTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAGTGATCTCTGCT
1921 CACTGCAACCTCCGCCTTCTGGGTTCAAGCGATTCTCGTGCCTCAGCTTCCTGAGTAGCTGGAATTACAGGCAGGTGCCA
2001 CCATGCCCGACTAATTTTTTTTTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCAAACTCCTGAC
2081 CTCAAGAGATCCACTCGCCTTGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCACGCCCGGCTAAAACATTGCA
2161 AATTTAAATGAGAGTTTTAAAAATTAAATAATGACTGCCCTGTTTCTGTTTTAGTATGTAAATCCTCAGTTCTTCACCTT
2241 TGCACTGTCTGCCACTTAGTTTGGTTATATAGTCATTAACTTGAATTTGGTCTGTATAGTCTAGACTTTAAATTTAAAGT
2321 TTTCTACAAGGGGAGAAAAGTGTTAAAATTTTTAAAATATGTTTTCCAGGACACTTCACTTCCAAGTCAGGTAGGTAGTT
2401 CAATCTAGTTGTTAGCCAAGGACTCAAGGACTGAATTGTTTTAACATAAGGCTTTTCCTGTTCTGGGAGCCGCACTTCAT
2481 TAAAATTCTTCTAAAACTTGTATGTTTAGAGTTAAGCAAGACTTTTTTTCTTCCTCTCCATGAGTTGTGAAATTTAATGC
2561 ACAACGCTGATGTGGCTAACAAGTTTATTTTAAGAATTGTTTAGAAATGCTGTTGCTTCAGGTTCTTAAAATCACTCAGC
2641 ACTCCAACTTCTAATCAAATTTTTGGAGACTTAACAGCATTTGTCTGTGTTTGAACTATAAAAAGCACCGGATCTTTTCC
2721 ATCTAATTCCGCAAAAATTGATCATTTGCAAAGTCAAAACTATAGCCATATCCAAATCTTTTCCCCCTCCCAAGAGTTCT
2801 CAGTGTCTACATGTAGACTATTCCTTTTCTGTATAAAGTTCACTCTAGGATTTCAAGTCACCACTTATTTTACATTTTAG
2881 TCATGCAAAGATTCAAGTAGTTTTGCAATAAGTACTTATCTTTATTTGTAATAATTTAGTCTGCTGATCAAAAGCATTGT
2961 CTTAATTTTTGAGAACTGGTTTTAGCATTTACAAACTAAATTCCAGTTAATTAATTAATAGCTTTATATTGCCTTTCCTG
3041 CTACATTTGGTTTTTTCCCCTGTCCCTTTGATTACGGGCTAAGGTAGGGTAGAGTGGGTGTAGTGAGTGTATATAATGTG
3121 ATTTGGCCCTGTGTATTATGATATTTTGTTATTTTTGTTGTTATATTATTTACATTTCAGTAGTTGTTTTTTGTGTTTCC
3201 ATTTTAGTGGATAAAATTTGTATTTTGAACTATGAATGGAGACTACCGCCCCAGCATTAGTTTCACATGATATACCCTTT
3281 AAACCCGAATCATTGTTTTATTTCCTGATTACACAGGTGTTGAATGGGGAAAGGGGCTAGTATATCAGTAGGATATACTA
3361 TGGGATGTATATATATCATTGCTGTTAGAGAAATGAAATAAAATGGGGCTGGGCTCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAG
3441 CACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTC
3521 TACTAAAAAACAGAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAT
3601 GGTGTGAACCCGGGAGGCAGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCTCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC
3681 TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAAGAAAATGGGAAGCAATATTTGACATAGTTCTTTTTAGTCAAATCTACTTGT
3761 TAAAAAAAGGGTAGCAGTTTATTCATCTGTGAAAGGAAAATAATACTTATCTTACAAGGTTGCAAGAGCTCAAGGAGACC
3841 ATGTATGTAAAGTTCCTGCTGTAAATATGAACTCCCATCCTAATACCCTTTTACCTCTCTGTGGGTTTGTCTTGACCTGG
3921 AAATTTGGGCTAAAACTTAGAAAAAATTCTTACATGATAACTCAGTGATGCTTACTCATAGTTTTTGGTGTTTCTCATAG
4001 ATAAGATATAAATCAGCTGGGCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACCT
4081 GAGGTCGGGAGGTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGCGTGG
4161 TGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGTGGTG
4241 AGCGAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAGATATAAATCA
4321 CAATAAATAAATAGGTCAATACAAATGTTAGCCAGGCGTGGTGGCACATGCCCATAGTCGCAGCTACTCTGGAGGCAGAG
4401 GCAGGAGGATCACTTGAGCCCATGAATTTGAGGCAGCAGTGAGCTATGATTGTGCCACTGTACTCCAGTCTGGGTGACAG
4481 AGTGAGACCCCATCTCTAAATAAATAGGTCAAACCCTTAAAAATATTTAAATTCTTAAAAAATTGAAAAGATTATTCTTC
4561 TCAAATTTAGTTGAGCTTTCTAAGAGAAGCAATTGGCTTTTTCCCACTTCAATAATCATTTTCAGTTTGACTCATACAGT
4641 TAACACAATGTGAATTTCTTCCTCAGCATAACAGAGTTATAGAATGACAGGGCTGGAAGTGACCTTAGAGAGTATCCAGT
4721 TCTTTCATTTTACAGGTGAGGCAACTGAGACTCAAAGGTGATGTAATTTGTGCAAAGATTATAGCTAATTAGTAGCAGAG
4801 CCCTGACTGGGACATAGTTTGAAGGTGAAAAACTTCACCAAGCTACCTTTCTTGAAAGGTCCAAATGTTTATGTTTTCAA
4881 CTACTCTTTCCACTGTACCATAACTTTCACTACATATTAAATGACACTTTATAACTAATATAATAGGACAATCATCAATG
4961 CATATATAGCCAGCCCTTCATATCTGTGGGTTTTGCATCCATGGATTCAACCAAGGAGGAATTGAAAACACTGAGAAAAA
5041 AAAAAAAGACCACACAATAAAAAAAAAAAATACAAAATAATACAAAGAAAAAGCCAAAATTGTCATACTGTTGTTAAGCA
5121 ACAGTATAACAACTATTTACATAGCATTAAGGTTGGTGCAAAAATGCAAAAAAAAAAAAAGCAATTATTTTTAAACCAAC
5201 CTAATATATTGTATTAGGTATTAAAGTCATCTGGACATGAATTAAAGTATATGATGCCAGCCTGGACAAAAGGCAAAACC
5281 CTGTCTCTACAAAAAATACAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGTGTGTGCCTGTAGTCCTGGCTACTCCGGAGCCTGAGGTG
5361 GGAGGATCGCTTGAGTCTGGGAGGCAGAGGCTGCATTGAGCTATGATCATGGCACTGCATTCCAGCCTGGGTGACAGTGC
5441 AAGACCTTGTCTCAGAATAAATAAAGTATGTGATGAAGATGTGCATACATTATATGCAAATACTGTTTTTTTTTTTTTTA
5521 ATTTAAACAGTCTCACTGTGTTGCCCAGGATGGAGTGCAATGGCACAATCTTGGCTCATGGCAAACTCTGCCTCGCAAGC
5601 AGCTGGGACTACAGGCATGCTCCACGGTGCCCAGTTAATTTTTTTTGTATTCTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTG
5681 GCCAGGCTAGTCTTGAATTTCTGACCTCAAGTGATTCATCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGGCC
5761 GGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTAGTGACTGGTTTCGCGGTGTTGACCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGATCTCAGGTGAT
5841 CTGCCTGCCTCGGCCTCACAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAACCACTGCTCCCGGCCTTGTGTGATTTTATCTAAGGG
5921 ACTTAAGCGTCCTCAGGTCCTAGGGGGTCGTGAAACCAAAACCCCAGGGATAGCAAGGGACAATTGTATCTTCAAAGTAG
6001 ACAAATGGCGCCGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCAGTTTCCGAGGCTGAGGCAGGCGGCTCACCTGAGGTC
6081 AGGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGCTGAAACCCTGTCTGTACAAAAATACAAAAATAGCTGGGCATGGTGGCGCA
6161 TGCCTGTAGTCCCAGCTACTAGAGCGACTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTGCAGGGAGCCAAG
6241 ATGGCGCCACCGCACTCCAGCCTAGGTGATAGAGTGAGACTCCCTCTCAAAAACAAAACAAAACAAAAAAATTAGACAAA
6321 TGCTACATTAATGTTTGGGTGGTCAGATTCTACTTTGAATCTGAAGTTTGCAGATATGCCTATAGATTTTTGGAGTTTAC
6401 CACTTTCTTATTCTGTATCATTAATGTAATATTTTAAATTACTATATATGTTACCATTTTTCTGGATTTAGTAAGAAATT
6481 TGCAGTTTTGGTTTGATGTAACAAGGGTTTTAATGTAATTTATGTTAGATTTTGCATTTTTTTCATTACTGTTATATTTT
6561 AACCTGACTGACTGATCTAATTGTATTAGTATTGTGAATAATCATGTGAAATGTTTTGAGACAGAGTACTATATTTGTGA
6641 ATATAATTTTATGGTTTTTTTCACTTAGAACCTTTCTGTGTGGAAAACTAAGAAAATTGCTTTCTGCTGTATAATCTGGC
6721 ATTCATTGTAGATTAAAGCTTATTTTTCTGTGAATAAAACGTATTCAATAAAATACTATTCTTTAAAATTATATCATAAA
6801 AAAAAAA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
|
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
ID | Duplex structure | Position | Score | MFE |
1
|
miRNA 3' guuUGUGGUAACAGUGUGAGGu 5'
:::||||| :||||||
Target 5' atcGTGCCATT---GCACTCCa 3'
|
4248 - 4266
|
140.00 |
-17.50 |
2
|
miRNA 3' guUUGUGGUAACAG----UGUGAGGu 5'
||:| ::|| || |||||:|
Target 5' aaAATA-TGTTTTCCAGGACACTTCa 3'
|
2354 - 2378
|
137.00 |
-11.20 |
3
|
miRNA 3' guUUGUGGUAACAGUGUGAGGu 5'
::|:||| |:||||||
Target 5' atGGCGCCA---CCGCACTCCa 3'
|
6241 - 6259
|
137.00 |
-20.60 |
|
DRVs in gene 3'UTRs |
|
SNPs in gene 3'UTRs |
|