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pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-122 |
Genomic Coordinates | chr18: 58451074 - 58451158 |
Synonyms | MIR122A, MIRN122, MIRN122A, hsa-mir-122, miRNA122, miRNA122A, MIR122 |
Description | Homo sapiens miR-122 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-122-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 15| UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUG |36 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
Circulating MicroRNA Expression Profiling | Circulating MicroRNA Expression Profiling |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | BACH2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BTBD25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | BTB domain and CNC homolog 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001170794 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_021813 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on BACH2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of BACH2 (miRNA target sites are highlighted) |
>BACH2|NM_001170794|3'UTR 1 TGACTCGGCTCTGCCTCCCAGTCCGCACACCTCTCCCATCCAGGCGTTCTTCAGTCAGCCTGTGGCACTGTTCATCTGCT 81 GTCCCGAAGAAACCGAGAACACATTTGGTGCACACTACAGCGGTCTTAGCAGCAATACTGTTCCGAAGTATCCTCTCCTC 161 TTCTCGAGCAGGAGTGATAGTTACCTTCACAATGGTGCTACCCCTTGCCCAGGCAAGGAAAGACAGCAGTGATGACACTG 241 TCTGTCTGTGGCTCAATTTCAGTCTTCACAGGGATAGACTACAACACCTCTAGGCCCCAACCACGGATTTTTTTTCTCAG 321 TGGCCCATGTCACAAACCCTATCTCAGGAATTTCTTCTGAATGTTCAATTTTTTTCATTGAAGACAGCTTCTATACACAT 401 CAAAGTTTTATAGCTAGACTGTACATATTATATATAATATATATATAAAATATATATATATATATATATATATCCATATG 481 CAAAAGTCCTGCATGCCTCAACTTTCTCATCCTAAAACTGGAAACTTATTTCTCATTTAGAAACAGGTTCCAACATTCCT 561 CTTCTTTTGTCTCTGATGCTAGAACTAGTTTGGTAACTGTTAACATGGTCATTTTTCTTGCTTCACAGTTCAATTTTCAA 641 TTCGTACTTATTTATGGACAAAATTCAGTGTTGGAAGCTTTTTCCCAAGGTTTTATTTCAGATTTCTTTTTCGTTTGGTT 721 TGGTTTTGGCACCTCCAAGTGGTGTCATTTGAGCATTGTAGGTTTGTTTTTTGTTTGTTTGGGGGGTTTTGTTTGTTTTT 801 GTTTTTGTTTTTGTTTTCCTTGCAGATACTGTACAGTAATGGTCAACTTTGCCACTTGCACTGAGTTTTGGGTCAAACCT 881 ATTTTCTTAAATGAAGTTGTAACTTCGGTATAACTCAAGTATACTGTATATTCTTTGCTTTTAGTTAAAAAAGTAAAACA 961 TTTTAGCTAATTAAAAAGCACTCAGGTGATAATTATGTAGGAAAAACAATCTTGCCAAATAATGAATTCATCCTAGGATG 1041 TGTAGACAATAATCTGCTTGAATATTTTTATATTTCACCTCCTCCCCACCTTTCCCTAAGCAAAGTTTAAACGCAGATAG 1121 AGAGTTCAGAGTTGATGCTGGATGTTCAGATTCCTAAGTGGGGAGAGAGTTTGGACATCTCACTCAAAAGTACATCAGAA 1201 AAACAGGAATCCGTGATTTTATACCAGAACTCAGCAGGCATTGGCTCCTAGAAATCAAGTTAGAAAGTTTTCACCCAGGG 1281 AGTAAGTCCCATTCATTTCAACACGTCCTGAGGCCTCGGCTTGCTCTTGGAAGTGTTGTGCAGTAGGACCTGCTCCCCTG 1361 AAGGACGGGGCCAACCAGCCACTGGCTTTCCTGCCCAGGCTTGGCCTCCCAGGACATCTGGCCTGAGGGGATTTGAATCA 1441 CAGCCCCGAAGGTCCTGCCTTCACCCCATTGGGAGAGAGCAGGGCATCCTGGCATCTGCGATCCATCCCTGACACAGGCT 1521 GACACATTCTTTCTCCTTTCCTTCTCCAAAGGCTTGGAGTTTTCTTCTGAGGTTTTTCTGCCAGTGTCTTGTCTGAAGGC 1601 AGACTTCATTCTGAGGCTTTGGACAAGCTATCACCGGGAACCCTCCCTGTCCCCTTCCCGAATCACACACATACCCTACC 1681 CTCACCTGATGATAATTTTCTCTTCTTGCTGCAAAACTGGTTGGCTTGCAACCCAGAGAGAGCAGCTTCCCTTGGCTCTG 1761 GGGCCGTGTTGGCCCCAGCCACGTTTACAGGAAGGTGTGCCCCAGAGGAGGAGGAATCAGCTCCCTCGCTCCAGTGGCCT 1841 TGGGTCCGGGTCTCACTGAGCAGCCCGAGGGCCACTCCAGCCCGGCTGGGGAAGAGAGTCCTGAACGGTTTGATGTGGGG 1921 ATGGGGTGGTGGGCAGTGGGGAATAGATGGTTGACTTTGTTTCTTTATTTGTGCCATTGTTTGGACAATATTAAAGCTGC 2001 ATGTAAAAGGGGAAATTAGTATATGATGTAGGCTAAAAGTGAAATCATAGTAACATATGTTTTAGTATTATTAACTTTTT 2081 TCTGTACAAATATTAGCACTAAATGTTTAAATATGTATGAATGCCAGAAATTTGTCAGTTCATGCAGTAGGATAAAAAAA 2161 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTTTTCTTTTTAAACAGTTCCACTTTTAAAACCTGCCTCTGGGTTTTTGTTTTTTCTTG 2241 TTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAAACAGATCTTGATAAAGCTCTGT 2321 GTTGGAGCTGCTGGTTTTTGTTATGGTTGTTGGAATTTCTTGGCCTACTAGGACAGTTCTGTGCTTCACCATGAGGTTTG 2401 CCTTTGTGGAAAACTGGTGACAGTGAGAATATAAACTCAATGTGAATCACGTGATACTTCGCAGGCGTGTGTTACAGTGG 2481 AGTCAGCTGACAGTATTTTGCTTTTTAACTCTATTGTTGCCTTTCCAAGTGACCTCTCCTCTTCTTTTAAAAAAAGAACA 2561 CTTTCTGCTCATATCATAACCAGGTCCAACCCAGCTTCTTGGCATGAGGTTTACCCTGGTAACAACTCATGTGCAACTGG 2641 TAGTCTTGACCACATTCCATCCATTTCCTCAGGTTTCTGTGGTTCAGTAGCCCAGACCTGTTTGGCAGCCATTTCTAGCA 2721 GGGGCGGGGCCTCTTTATTTCTCTCCACCCTAACTCAGACCTCACCTTCCTCCCACCCACCCCTGCCTTGCTTTTCTTCC 2801 TCTTCCCCCAACCTAACTTCTGCCATGGGAACTGGTTAAAAACACTGCTCTAAAAACCATCTTCCAATTTCATAGAGATT 2881 TCTCACAAGTTATTTCATTCATAATCCACCATGAACAGTGACTAGCTTCGTGCAGTTGTTCATGTGATGTGTGTGTGTCT 2961 TTTCCTATTCAGAACTATGTGCTTGTCAAAATTATTTCTGGGTTGATTCAAAGGGAGGACTTGCTGGGGACCAGAATCCA 3041 AACGGCCTCAAGTGGAATTTTAAAACCTAGCCTGTCTCTTTTCCCTGGGATCCCTCTGTCAACCCCACGCCTTTTAGGAA 3121 AAAGAAAAGTGAGTGAACAGCAAGGAAGAGTGTTTGCACAGTACAGTAACATTTGGTTGTTCTTAAGGCTCTTTTCTTAC 3201 AAAAATAAGAGACCCTCCAACCACGGGCTGTTTAGGAGGATGCCTGCTTGGGTCTCCAAATGGCTGGGGTAGGAATGGTT 3281 GTTGGGGCAGAGCCAGTGGAGGTGAGTGACCCTGAGACTAATGAACATCCCACCTAAATCCAGTCCTCCCCTTGGATCTG 3361 CCTTTGTCCTGCTTGTGTATCCAGGCAACCTCTTTTCAAGTTGGTCAGGCTTTGGACAGGTGAGTGATTTGCTGTATGTG 3441 TTTGTTTCTCTGCGTTACCTGGGGGTGCCTTGATTAAAATCGAACTTTATTACATACTGATTCTGGAACAAAACAGTTAG 3521 AAAAACTTTAAAAAAAAAAAAACCGACAAAGTTACGAGGCCATCCTGCTATTTATCTTCTGAGTTCCCAGCAATGACTCA 3601 GGCATCAGAGATGATGCTGCAGTGGAAAACCTGACTCTGTGTGTCTGCAACTGAATGTTGTGCGAGTAATTTATTAACTG 3681 TCTTTCTAAAGGTTTGCTGCTTTTAAGATGCACTATAATTCGGGATGTAATCCTTACATTGCTTTTCCAAGGAAGGGAAC 3761 AAAAGTCTAGTGATTAGTATGCCAACTGCCACTACTCCTTCAAAAGGAGCCAGGACCAGCGACAAGACTCATGAGAGGAC 3841 TGGCTAAAGTGAAGTGTGCACAGTGTGAAGTTTAATGCTGTTGTCAAGAGGCCTAAACCCACATTTTCTCTTTTAATATT 3921 TTATGATTGCCATCAAAGAAGAAGAAAAAGAAGGAACAGACAAAGGTTTGAAAATGATAAGCCTGTTAAGACACCAAAAA 4001 CTCCTGTCCCGTGAAGCTGCTTGACATCCTGTGGAGTAGCATAATCCTCTCAAAATGAGGAAGAGCTGCCTGCAAAGCTT 4081 TCTCAAGTCCCTATTTGGCTACCTACTTCTCTACATTATGCCCCATTTAAACTAGGAGCTGTCTTAGAAATGACTTCAAA 4161 CTGCTTCACTATTGCTTACAGTTTAGGAGGAGTCTCAGATCCAGAAGGAGCAAGAATCAAGTTTGGTCCTCAAATGACTG 4241 TAAATAGACTAAAGAACAAGGTGTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTCTAAGAATAAAGCTGTTCGTTGTATCATGAGTTA 4321 GTGTTTCTTCCCCAAACTGAAGACTGTGTTGGAAGTGCAATTTCTGGTGAGTCAGTCCACAATACAATGCCCTGTGTGGA 4401 GTTGGTATTCATACAGGAAATCTGTGTGCACGAGGCATTGTGTGTTGAAAGTGTATGTTTATAGTACTGCCTGAGCCATC 4481 TCATGACCCCAGCGTCCAAAACCGATGCTGTAGAACAGAACATATCTGTACACAAATAGTGTGTGCAAATAGCATTTGTA 4561 CATAGAAAAGTCTCATTGTGGCAGATTGAGCATAAATTATTCAACTGACGGTGCAAAAACATTACTTGCAAAGAAAAGTT 4641 TATAGTATTTTCCTACACTCCACCCTGGGAGATGATATTTCTATCAAATGAATATCAGTGCATTTTAAATGTAATATGAA 4721 AACGATGCTGCCATTTTGTGAAGAATACCCACTTGGTTGCAGAGGCCAACTTTCATAGCTTTGATTTAATGTTGTGACAC 4801 GGTGTATGCATTTTGCTGTCAAGCAATGGATAAACAGCTCTGACTTTCATTCTCATTCCAGTTTATTGACCTCAGATAAA 4881 ACACTGGCCCTTCTTAGAAGCAGAAGTGTGCACCAAGACCATTCATTTCAGGTAGACTCACATTCAGTGCCAAGTGCTCC 4961 CATGGGAATAATCAGACGCATATGTTGCGAAAGAGTGAAGGGACTTGGACAAAGAGGGGTTTTCCTACAGATGGATGCTC 5041 AGTCTTCTACCAAAACATGTTTGGAGGCAGAACTATGACCTCCCCTTAAGTCCTAACAATGTATTTTGTGTGTGCAAATC 5121 CTGGGATGCCCGTTTCACGCTCTGACATAAAGACATGGCACCTCTAGTGAGTGATCAGGAAGATTCCATATGCATTTGGG 5201 AGCTTCAGGTGCTTGTTAGACACAGTGAGCCATTCAAGGCAAGCACCACCTTTGCTAGTGAGGCCAAGAGAGCCTGTGAC 5281 AATTTGACAATTTGTTCCAGAACCAGTCTGATGCAAGTGCACCTCTAATATATGCCTTACAAACTCCAGAGGCCATATTC 5361 AAAACAGGGTCTTCTCAGTGTATGCAAGGGGCTGCAGCCCCTCTTCTCTTCCTCCCCAGGTTGAACAATACGGACAGTTT 5441 TCACACATATCTACCTGTATAACCCTCTGTACCTCTCATAACTGGTCAACGACTGTAACAGGTTACATCAGGTGTTTTTC 5521 TACATACTTTTTACACAGATTCTATGCGATTAATGTAATTTAATTCAATGCATCATTTTATTGTACTAGTTCTTAGGCTT 5601 GTCCTTATTTTTTTCTAAGTGATTGTGGTTTTTCTCGTGGTTTTTATTGTAAAAAATGAAAGGCTGTTGATGCTTATTCT 5681 CTGTAACTAAGAATTTTTACCTTTTGGGGGAAAAAAGCATTGCTATGAACTAATGAATTGAAACTTCATTTACTCATTGT 5761 AAATACACTATTGTGCAAAAAAAGTTTTCACTCAATTGAATTGCTAGTGTTAACTGAATTTTGTCTAGACACCATTTCTG 5841 TTGATGAAATAAAGACATATCATTATGCATTGTAAACTGAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Article |
- Tsai WC; Hsu PW; Lai TC; Chau GY; Lin CW; et al. - Hepatology (Baltimore, Md.), 2009
UNLABELLED: MicroRNAs (miRNAs), which are inhibitors of gene expression, participate in diverse biological functions and in carcinogenesis. In this study, we show that liver-specific microRNA-122 (miR-122) is significantly down-regulated in liver cancers with intrahepatic metastasis and negatively regulates tumorigenesis. Restoration of miR-122 in metastatic Mahlavu and SK-HEP-1 cells significantly reduced in vitro migration, invasion, and anchorage-independent growth as well as in vivo tumorigenesis, angiogenesis, and intrahepatic metastasis in an orthotopic liver cancer model. Because an inverse expression pattern is often present between an miRNA and its target genes, we used a computational approach and identified multiple miR-122 candidate target genes from two independent expression microarray datasets. Thirty-two target genes were empirically verified, and this group of genes was enriched with genes regulating cell movement, cell morphology, cell-cell signaling, and transcription. We further showed that one of the miR-122 targets, ADAM17 (a disintegrin and metalloprotease 17) is involved in metastasis. Silencing of ADAM17 resulted in a dramatic reduction of in vitro migration, invasion, in vivo tumorigenesis, angiogenesis, and local invasion in the livers of nude mice, which is similar to that which occurs with the restoration of miR-122. CONCLUSION: Our study suggests that miR-122, a tumor suppressor microRNA affecting hepatocellular carcinoma intrahepatic metastasis by angiogenesis suppression, exerts some of its action via regulation of ADAM17. Restoration of miR-122 has a far-reaching effect on the cell. Using the concomitant down-regulation of its targets, including ADAM17, a rational therapeutic strategy based on miR-122 may prove to be beneficial for patients with hepatocellular carcinoma.
LinkOut: [PMID: 19296470]
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MiRNA-Target Expression Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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