pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-122 |
Genomic Coordinates | chr18: 58451074 - 58451158 |
Synonyms | MIR122A, MIRN122, MIRN122A, hsa-mir-122, miRNA122, miRNA122A, MIR122 |
Description | Homo sapiens miR-122 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-122-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 15| UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUG |36 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
Circulating MicroRNA Expression Profiling | Circulating MicroRNA Expression Profiling |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | ACVR1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ACVRLK7, ALK7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | activin A receptor type 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_001111031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_001111032 , NM_001111033 , NM_145259 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on ACVR1C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of ACVR1C (miRNA target sites are highlighted) |
>ACVR1C|NM_001111031|3'UTR 1 TGATGATAATTATGTTAAAAAGAAATCTCTCATAGCTTTCTTTTCCATTTTCCCCTTTATGTGAATGTTTTTGCCATTTT 81 TTTTTTGTTCTACCTCAAAGATAAGACAGTACAGTATTTAAGTGCCCATAAGGCAGCATGAAAAGATAACTCTAAAGTTA 161 AGCATGGGCAGGAGTTGACTTCATCCAATCTCTATGTTATGTTTAATTTTATTTTGAAAGCAACACCTCAACTCATCTTT 241 TTATTTAATAAGGAAGAAATATATTACAAAAGTATAAAATAAGCTCTATAAAAATGTTATAGTCATTAAGTTTTTATTTT 321 ACTTGAACCAAGAGCACATGAATGAACAGGAAAAGATGTAAAAACATTTTTTTCTGAGATGAAAACATATTAATTAAACA 401 TGCAAATTAGAGCATGCTATCTTTAGGTGATGCAATCTATGTTTCCCCCTTTTTAAGTTAGCAGGACTTTTTAAAAATAA 481 ATATTGCTCTAAACTTTAATATATCGAACGTGAGAGTGGAGCTGCTTAGTGGAAGATGTAAGTGAGGTGGGTGTCCCATG 561 TGCTTGGTCTCCCCTTCTGCTGTTCTCCTGTTCTTCATAATCCACTACTGCAGCAGTCCCTGAACCACTAAACTTGTTCC 641 TTTCATTTACAAAAGAGATACCTGACATCCTGAGACACTGAGAAATGTCCTGAAGTCACACAGCTAATGGCAGAACTGGC 721 ACTAGGTCCAAATCTTGTGATAATGAACACCGTAAGGTTAGCTAGCTTCCTACTTTCCCTTGAATAGTGCTTTTCTCCCT 801 ATGTAATATCTTTTATTATGATATTTGTGGTTTAGAAGGCATATTGAGTTATTTTGCAGAATCATAATGGACCCGCACAA 881 AATCTCAGAACCATATCTGTTGACATTTTTTCTCATAGAAATATCATGGTTACCCCATTTGTTAATGAGCATTAATGTTT 961 TCTGAACACTTCCAAAGATTAATCAAACATAAATATTCATTGTCTGAAAATGTCTTTAAGATACAATTCAGAGGTCCCTA 1041 TTTCCTTTGTACATACACACTTAGAAAGAAAAGACAGAAAAGGAAGAGGAAGGAAGGAAATATTTTGAGAATATATTGAG 1121 AAGAATTAAGAAAACTCTTCAATGAAGTGTTAACAACCAAACCCTACAGACGGTATCAGAAACAGCAAATAGATATTCCT 1201 CTACCCTTTCACAGTGAGTGAGTGAGTACAGAAGAATGCTCATGATAGTTTTGCCTTCATTCTACTTTCTGTGGACACAG 1281 AGTAATGAATATTTAATGGGACATTAAATATGCCCTTCAAATCTATAATTTTACTTTGGTAAACGAGATTTAACATGATG 1361 TCTTTTATGCTCCTAAAACATCTTTTTTCAAACTCCATTCCTTAGAACATTCTTCTACTGAGATGATCCAAGACCAAAAG 1441 TGTTCTTTGGTACTTGCTTATAAAGTGATAGTACATGTTAGCATATAATGTATTTTGAAGAGTGAAGTAAATGCTATTGA 1521 TAACAGTAAAAAAAAAAAAAAAAACTAATAACAGTAAAGAAATGCTACTTGATTTTTTTTTAAACTGGATTGCTCAGATT 1601 ACCTGATCGTGGTGGAACCCTTTTATTAAGAGGAGGGGAAACTTTTTACTATCCCATATTTAACTGTTCTATAAAGCAAA 1681 GCACAGCTTGGGTAATAGCGTTCTGAAGGATATACTTCTGTATTTTCTCATAGAGTACAATTTAGTGATTATGCTTCATT 1761 TCACTATGGAAATATGTTACTGAATCTATCTTCATTTTACTGAGTTGAAATAAGGAAGGCAAAAAACTGACAGCTATGGA 1841 GTTTGCGTGTACTTCCATACTCGTTAATGCTCTCATCCACTTATTAAATAATCATAGAGCACCCATATCTTGCTTGCCAC 1921 AATATCGGGTACAAGAGGGAATACAAAGATAGATAGGTCCTGCCCTCAGGGATTTTAAAGTCTAATTTGGGAATGGGAAT 2001 AGGGATGTGAGTGTGTGGGGGAAGAGATTAAATTGACAGATAAAATACGAAGTGGGATGTCTTGAGTTCTGCATGACAGT 2081 GGGTTTCTAGGATAGGTCTGAAAATTGCTTTCATTTGCAACACATTTAGAAAGTAGCTTTATTTGGATATTACAGACAAT 2161 CTAAATATATCATCAGTTTTTAAAAGTGCCTATGTGAAGTGATTTTTAAAAAGAGCCTATGTGAAGGGGTAATCTTGCTT 2241 GTTCTTGTTACTAATTTCTCATAGATTGTTTTTCTGCATATATAAGAACGAAATTATTTATTTACTATGGTTGTACGTGC 2321 CTCAAATAAACAAGAATGATATTTCCTGTTTTATTTACTTATGTTGGGTAAATATGCTTATTGAATTTTTAAGAGAGGAT 2401 TTTTTACCATCTCCATTTTTCTTGTCATTATGTTTTGTAGCTTATTTGAGGGTGTCTAAATATAATTTCATATTTTATTG 2481 GTTCAACTTTCACTCTGAAGAAATCCGTATGTTAGTACATTTTGAGGTATTTTTCTTGTTCTTGTGTTGTTTAACTATGA 2561 CTCCTAACTGAGTAGTCTTATATTTCAATTACAAAATACATTTTTTAAGAAAGGGAATAGAGCAGCAAAAATGATAAGGA 2641 AAATGTTAAAAGTTGTAATATTTCCTTTACTCTTAACAGGATTATATATAGAACATGCTCACTTACAAAAATAGGATGAT 2721 GAAGTTTAGAGCATAAGGCAGGCTTCTTGTATATACTTATGCTGTCAAATGTTATATTGTTTTTAATGGAGTCCCATTGT 2801 GTAATATTTATTTCTTTTACATTTTGTTATAAGCAAAAAAAAAAAAAATTCTCCTTAGGTTATGTTCAGAGTATCAGTGT 2881 TCTTTACTCCTTACAGATATTTTGGCTTTGGGGTATAATACAAGACTTGGGAAAACACTATTATGAATTTTCAGTACTGT 2961 ATAAAGTGGTGATGGGATTTAAATGCAGCATCACTTTCTGAAAATAAGAGAAACATTATTTGTTGTCAGTATTTCAGCAT 3041 GAACTTGTTGCCTTGTAAATTTTGCCTTTAAGTTTGTAATTGGTACAGATTCTGTTGTATGCTTTCTTCTATGTCTAAAA 3121 TATTTGGCATGTCACATCTAGAATTCTTAATTTATGTTCTGACTTGAGAGTTAAGTGAAACATGACTGTCGTGCACTATT 3201 TTAGGCATAGCACTTGCTTTTCATCTTTATACTTTCAATTAACTTTGCATTTTAAATTTCCATGATTGTATGAAAATAGT 3281 AACCTGGTTGCAGTATCTGAAAAAATTAAAATTAGCTTTTATTTAAAAATGAAAATCTACAATAGATTCATTAGGTTAGA 3361 AGTTCCAGAATAATTTATTATTTTATTACACCTACTATTGTAGAATTACTAATAAAACAAAACAAAACTACTCCTATTTT 3441 CCTGGAATTTTGCCACCATGTGACTTATTGGGGCAGAGAAAACTCAGGGTTGTCTTTGAGTCTGCACAAAAGCACCAGGG 3521 AACCTGCTTAGCAAATCGTCTGAAAACAGGGAGCTGATGTTTGCCATTATACAAAGTTTGAGTAAACAACTTAAAATTGC 3601 TTGTTAGGGCATAGTCTTTGATTGAAATAAGTATGAGAATGTATTTGGCTAAATAAATGTATTTAAAATATACAAATTTT 3681 ATTTCCCACTGGAAAATTAAGAAAGTAGCAGTACCAAATGAATAAAAGCTGGCAGTTGATGTCTTCAATAATCATTCCTT 3761 TAAAATAAATTCACAAACACATCATTACAAGCTACTTAGAAATGTTTAGTATTCGTATCTTAAAATGGCACCATTGTGGT 3841 TTTCAAAGATATTTTAAACATCTTTTGTGAAACATACTATTTCTGTTTGACAATGCTTTGTTCTAGCTCTGTGTGCTGAT 3921 ACCTACATGGAGTTTTTCTGCTATTTTAGTGAAAACAGTAATTCTTTTATCTTGAGAGCTGCTTCTAAATAACAAAAAAG 4001 TTAATTGGAATGTAAGTTTTTAAAAAATGTTAATATTAAATAGAATTTTTATAATATGGGCATTTTTCAAAACATTTTAA 4081 TGAAAATATATAGATATTTGACTTTCTTTTTTTCATCTAGCCTTGCTTTATATTTCATTATTTTTCTCACTTTTTTTCTT 4161 AATATTCCCTCACTATCTTTCAACATTATCATTAGTTCCTAATTTTAAAAATAACTCTTATTTAACTTAACCGTCTGGAA 4241 TTTAGCCTTCTAATGAAAGAGAATCCCTTAGTACTCTCAGAGATTATATAAAGTTATTCCAATTTTGTGTAGATGACGAA 4321 ACCAAGGATCAGAGATTAAATGACTACTAGTTACTAGCAGAACTCTTATGAAAGCCTGGTGGTGACACCCAGCACTGTTC 4401 CCTGCCATATCCCCAACTTTTACTGATTAAAAATTAATTCGCATGCATCTAAACCTACCTTGAATGCACACTAACGTAAT 4481 GTGCCATTCAATGATGATGATAAAATCCCACTTTTCTTTGGGTTTCTACTAAAATAATTTACTCACTCAGAGTGAGGTCA 4561 ATGAGAAAAACTAAACTAGGCTAAGAAAGAGTTGTAGAATGGTTGTTGAGCTAAGTAGGCAACCACTGGGGTGCTGATAA 4641 AATTAATGGATAAAATTTAGGAACTGTGAGAGTATAGAATTTCTTAGTGCAAGTAATGATTAGAGAAGCTTCCTGACATC 4721 CCCCACCCTTTCTGTAAGGACTGTTCTTTCTCTTTGTACCTTGGAATGGGGGTGAAAGGTGATTTGATAGCTGAATTTGG 4801 GACTATGTCCAGTGGGATATTATCTAACTTTTCTCTCTTTCTCTTTTTTTTCCCCTCAGTTTCTCATTAGTTTGTCTTTG 4881 GCATTCATCTTCTTTTAGTGCATTAAAAAATGTTTGGCAGATCTCATCAATCCCAAGTCACTCTATAATTCCTGTATTTC 4961 TTTAGTTGTCGTTTAACCTGTCCAAACTTCTACACAATGAACTTCTTAACAAGATTTTAAGTTCTCTGTATAAGAGGTTT 5041 CACCTCATAACTTCTCCAGTAATCCTTCATTTGGCACTATAGAGTATTTGTTAATGGCAGAGATGATTTTTCTTTTAAAA 5121 CCTAAAAAGACTAGCTGTTATTTGTATTCTAGCTTTTAGCTAACATATAAAGAATGTCTACTTTTGCTTTAATGCTAAAT 5201 TCCGCTTGAGAAATAGTAACTGGGAAAGACAATTTGAAATATATGCCCCATAATGTGATTGTTAAATTTATTTCTGCTGT 5281 TCCATACCATTGCTTTGTTTTGCTTTTGACAAACTAAGCCATTATGCTATTAGTTTGGAATATAATACTACAGCAAAATT 5361 AGGTAACAATCCCTATTTTAAAATTCCCCTAACAATAATAGAACTGCCAGCATACTTTTCTCTTTCAGTTGTAGATGAAT 5441 ACATTCGAGAGAATATGAGCTGTATTTCATCCTAGATTTTAATATTTTCAGATGTGACTGTATTTCCTGATCATTGGTCC 5521 AAGTTGTCCTAAAAGAAATTTTTCTCTCCAGACCTAACAGTTTTAACTGCAAGAGTTTACTGTGGGTTATGTTAATCTGA 5601 ATTTTAATAGGGCCACTAAGAATCTGAGTGCCTTAGGAGATTACCCTTATACCCACTGCCATCACATCCAGTCAGGCCTG 5681 TTGTGCTCTATATAAATCTTCCCAGCTGAGGGGCAGGTGCGGGCTAAAATCCAACTGCAATTGGCTCCCAGACATAATTT 5761 TATATTTTACAGAGAAGCATCTTATTGGCTTATATGTGTTTAAAGAATGGTCTGGCTTATACATCTTCAGAAAATGAGAA 5841 TTAAAAAGTCAAAATAATTCTTGACATCTACAGATTGAACAAAGAACTTAGAAGAAATAATACTTTATCTTTTCATCCTG 5921 GCATTCCTGAGAGAAGAGAAATTGATTGTTTATCATGTTGGTTTAATTTTTCAACCCAGACAATCTGCAGCAAGGCACAT 6001 GGACCCCAATTTTGATATCGTCCATACAGTTTTCATTCTATGCATGGAGCTAATTACTGACTTTGCCTGTAAAGAGAGGA 6081 TTGTGTGCCTAAATTTTGTCTAACAAATGCAAGCGTAGAATGACATTTACTAATATTTCTATTTCTTCCATAGGCTAAAT 6161 AATAGTAACTAAGTATTTTTAAGGACACAGCCCTTTTTTTCTCTTTATACAAAATGAGAGTATCTGAGCCAAAATATTAA 6241 ATTCTAGTTCTTTTCCGCAATGACTAGTGTCAAGCTCATGTACTCTTCTGATTCTAGACTGGAGAAGATTATTCAAACTT 6321 GATCTGTGTTTCAGGTTTTTAAATGTCCTAAAAACAGAAAATTAGATTCAGATCTCAAAAAAGGAATTTTGGATTGACTT 6401 TCAAAGTACTAATACTAATTATACTTTTCTTTTGGTAGCGTGACTCTTCTTATACCTAAGAACATATTACAAATGTCAAA 6481 ACCATTGCATTTTGACATTGCAAAACATGCCTTGAACTCTTGAACTACTGTGAAAAGAATCACCGTTGTAAAGACTTTTT 6561 GTAAGCTAGCTGATACTCTTAAGTATGTAAAAAGATTGTCTTTCAGCCGACAGGCCCAAAGGAATGTATATAAGGAAGGA 6641 ATATGAAAAAATAAATTAGGTTTTAAAATAGGAATTGGGCAATAAACTGTATCAAAAATATGTAGATGGATTTTAGTAGT 6721 TGTAATTTAAATGTGGAAGGTGAAGAGAATTTCAAACTCCAAAGAGAAATGAATGATATTCAGATGTTTCATTAATTTCT 6801 AGTCTGTGAAAATATGCATTTTATAGTAATATGTATAGACTTATTTTATTTAGAAATAATAGTGTTTTAGAATTTATTAA 6881 AAACTCAGTGATAGCCTTTATACCAAAATGTTTAACTTTACCAACAGCAAGTCATAAAAGTATTTATTTTAAAGCTTTTT 6961 AATATTATCGTGTAACTTTCATCTGTCTTCAGATGTAAATAATTATCTGCCTAAATGTTATATTTTTATGTATGCATTTT 7041 CTGAAAATGTATTGTTTTGTAAAGTGGGAAAGATAATAAATCAAGCACTTCTTGCACTTGTTTCTGTGAAGCATATAGAA 7121 CTCTATTTTAAATAAAGGAAGATGTGTCGTAAAAAAAAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Non-Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | xx |
Validation Method |
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Conditions | OV2008 , A2780s |
Disease | 0.0; |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | FindTar |
Original Description (Extracted from the article) |
...
"Western blot analyses revealed that miR-376c
... - Ye G; Fu G; Cui S; Zhao S; Bernaudo S; Bai et al., 2011, Journal of cell science. |
Article |
- Ye G; Fu G; Cui S; Zhao S; Bernaudo S; Bai et al. - Journal of cell science, 2011
MicroRNAs (miRNAs) are small noncoding RNAs that have important roles in gene regulation. We have previously reported that activin receptor-like kinase 7 (ALK7) and its ligand, Nodal, induce apoptosis in human epithelial ovarian cancer cells. In this study, we examined the regulation of ALK7 by miRNAs and demonstrate that miR-376c targets ALK7. Ectopic expression of miR-376c significantly increased cell proliferation and survival, enhanced spheroid formation and blocked Nodal-induced apoptosis. Interestingly, overexpression of miR-376c blocked cisplatin-induced cell death, whereas anti-miR-376c enhanced the effect of cisplatin. These effects of miR-376c were partially compensated by the overexpression of ALK7. Moreover, in serous carcinoma samples taken from ovarian cancer patients who responded well to chemotherapy, strong ALK7 staining and low miR-376c expression was detected. By contrast, ALK7 expression was weak and miR-376c levels were high in samples from patients who responded poorly to chemotherapy. Finally, treatment with cisplatin led to an increase in expression of mRNA encoding Nodal and ALK7 but a decrease in miR-376c levels. Taken together, these results demonstrate that the Nodal-ALK7 pathway is involved in cisplatin-induced cell death in ovarian cancer cells and that miR-376c enhances proliferation, survival and chemoresistance by targeting, at least in part, ALK7.
LinkOut: [PMID: 21224400]
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MiRNA-Target Expression Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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