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pre-miRNA Information | |
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pre-miRNA | hsa-mir-122 |
Genomic Coordinates | chr18: 58451074 - 58451158 |
Synonyms | MIR122A, MIRN122, MIRN122A, hsa-mir-122, miRNA122, miRNA122A, MIR122 |
Description | Homo sapiens miR-122 stem-loop |
Comment | The mature sequence shown here represents the most commonly cloned form from large-scale cloning studies . |
RNA Secondary Structure | ![]() |
Associated Diseases | ![]() |
Mature miRNA Information | ||||||||||||||||||||||
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Mature miRNA | hsa-miR-122-5p | |||||||||||||||||||||
Sequence | 15| UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUG |36 | |||||||||||||||||||||
Evidence | Experimental | |||||||||||||||||||||
Experiments | Cloned | |||||||||||||||||||||
Editing Events in miRNAs |
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SNPs in miRNA |
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Putative Targets |
miRNA Expression profile | |
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Human miRNA Tissue Atlas | |
miRNAs in Extracellular Vesicles |
Circulating MicroRNA Expression Profiling | Circulating MicroRNA Expression Profiling |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gene Symbol | AKT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | MPPH, MPPH2, PKB-GAMMA, PKBG, PRKBG, RAC-PK-gamma, RAC-gamma, STK-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | AKT serine/threonine kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcript | NM_005465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Transcripts | NM_181690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Putative miRNA Targets on AKT3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3'UTR of AKT3 (miRNA target sites are highlighted) |
>AKT3|NM_005465|3'UTR 1 GTCTCTTTCATTCTGCTACTTCACTGTCATCTTCAATTTATTACTGAAAATGATTCCTGGACATCACCAGTCCTAGCTCT 81 TACACATAGCAGGGGCACCTTCCGACATCCCAGACCAGCCAAGGGTCCTCACCCCTCGCCACCTTTCACCCTCATGAAAA 161 CACACATACACGCAAATACACTCCAGTTTTTGTTTTTGCATGAAATTGTATCTCAGTCTAAGGTCTCATGCTGTTGCTGC 241 TACTGTCTTACTATTATAGCAACTTTAAGAAGTAATTTTCCAACCTTTGGAAGTCATGAGCCCACCATTGTTCATTTGTG 321 CACCAATTATCATCTTTTGATCTTTTAGTTTTTCCCTCAGTGAAGGCTAAATGAGATACACTGATTCTAGGTACATTTTT 401 TAACTTTCTAGAAGAGAAAAACTAACTAGACTAAGAAGATTTAGTTTATAAATTCAGAACAAGCAATTGTGGAAGGGTGG 481 TGGCGTGCATATGTAAAGCACATCAGATCCGTGCGTGAAGTAGGCATATATCACTAAGCTGTGGCTGGAATTGATTAGGA 561 AGCATTTGGTAGAAGGACTGAACAACTGTTGGGATATATATATATATATATAATTTTTTTTTTTTAAATTCCTGGTGGAT 641 ACTGTAGAAGAAGCCCATATCACATGTGGATGTCGAGACTTCACGGGCAATCATGAGCAAGTGAACACTGTTCTACCAAG 721 AACTGAAGGCATATGCACAGTCAAGGTCACTTAAAGGGTCTTATGAAACAATTTGAGCCAGAGAGCATCTTTCCCCTGTG 801 CTTGGAAACCTTTTTTCCTTCTTGACATTTATCACCTCTGATGGCTGAAGAATGTAGACAGGTATAATGATACTGCTTTT 881 CACCAAAATTTCTACACCAAGGTAAACAGGTGTTTGCCTTATTTAATTTTTTACTTTCAGTTCTACGTGAATTAGCTTTT 961 TCTCAGATGTTGAAACTTTGAATGTCCTTTTATGATTTTGTTTATATTGCAGTAGTATTTATTTTTTAGTGATGAGAATT 1041 GTATGTCATGTTAGCAAACGCAGCTCCAACTTATATAAAATAGACTTACTGCAGTTACTTTTGACCCATGTGCAAGGATT 1121 GTACACGCTGATGAGAATCATGCACTTTTTCTCCTCTGTTAAAAAAAATGATAAGGCTCTGAAATGGAATATATTGGTTA 1201 GAATTTGGCTTTGGGAGAAGAGATGCTGCCATTTAACCCCTTGGTACTGAAAATGAGAAAATCCCCAACTATGCATGCCA 1281 AGGGGTTAATGAAACAAATAGCTGTTGACGTTTGCTCATTTAAGAATTTGAAACGTTATGATGACCTGGCAACAAAAAGT 1361 AATGAAGAAAATTGAGACCTGAGTGAAGATAAGAAATGATCTTTACGTGGCAAAATGAACACATCTTGAGTATTTAGGAA 1441 ATGGGCAGTGAAGGCTAAGAACCTGGTGTGTTTCTTGGGATCATGGTACATTTATCACTGAATTAAGCCATCAGGGAAAA 1521 AACAACAAAAAAAGAGAACACCTCCAGCTTTTCTTTTTCTGTATATACTCATGTCCCCCAGATTCCAACATTTCTCACTG 1601 AAAGGGGGCATGTATGCAAACCTCATCTTTCTCCTTCATTAATGATGATCTTCAGATTAAACCCTTTGGTGCTAGGAGCT 1681 GACAATTTCCAAAGCAGCCTGTGAAGTCCTAGGGGCTGGGGGCCACTCTTGCGGCAAGCAGAAGGCCATCCTACTCCGCG 1761 GAGTGATCATGGAAATGTATTTTAGTTAAACTCTGACAGCTCCCAAACGGAAGACTACAGCATGACGTAGTATTATGATT 1841 GCATTGTATGAAAGAGCAAGTGACTTTCTAAGTAGGATGAATCATATTCATATGCAGATGTCTTAGCCTCTTGACGCTGG 1921 AAGTGTGGATTTATAGCTATGAAACCACTGCTGGCAGTGGGTGGGCCACTGGGACTGACGGGGGTTAAAGGGCATTTTAC 2001 TAAGGCAGCTAAGACATATTCAGACATCAACGTTATCCTTCTTTTTCATATTTCTACCTGAGTGAAGTTCATCCTTAGTA 2081 TTGAGTAGGAAGTTACAGTAAATGGTAGTTCATTCTTACTTACACACATAGCTAATCTTTTTTTTTTCACTTGGAATTAT 2161 GTTGAATGTTTCATTTTGACAAAAAAGTAGACTAGAAGGTATGTTCTTTAAGTTGTCTTGCATCCATTATATAAGAAAGA 2241 AACAGGTGAGAGGAAGAGCAGAAAGCTGAGACTGGCTGATGTTCAGAGCACTTACTCCTCTAGAGGGAAAGCATGACACC 2321 GAACACTAAGCACACAGCTTTTTGTTGTTTTGGTTTTTTCTCCCGCAAATCTTAAAGTGATTCCCATGACCTTGGCCAAG 2401 GACACTTCTTAAAGATTAATGACTGGCACTGACATTGCCCCAGGCGGGCCACTCCTCACACTGGCTCTCAGTTCCCAGCC 2481 ATGCCTGGGGCTCAGTCACTTCTATTCCACCCTCTGAGACTCCATTGGTGTCACACAAGGTGTCTTCTTGGCTTTGATTT 2561 TGAGAATCCCCTATTTTCACTTCCAGATCTGTCAGCTGCCATGGAGGAATAATAGAAAACCAGAAATGCGTGTAGAGGGA 2641 GATTTCTAAAACTTCCCTTGTGTCGCCCATAGTTGTAGTTTTGGGTTCTGGCAGGTGGAACACCCTGAAACCTGGAATCA 2721 TTCTATGAGAATACAGTTCAGACTTTGCAGACTCCAGCCCATACTAACTGTCATGAAGCTTGACTTCTTGTCATAATGCA 2801 GCCATCTTGGAGGAAATTGGCCATTTCTGCTTAGATGGTTGGCAGGGTCGCGCTCAGCTTTGCTTTCTACACTAATTACA 2881 TAGCATTATTCAAGTATTGTTTTCCATTTCCCATCCCTGATTTCCAGCTTCTTAAAGCTGACTGTTCTTGCAGGGGCCAC 2961 TTGCTTCTCCTAGAGTACAAAAGTAAGGGCCTTCCTTACTAACTGCAGGGTCTCTCTATTACACCTCAACATACACACTT 3041 TGCTGCTACTGTTTGTACTGTCTACAGTAGAATTTCCTTATCTTGCTCCTGGTAGTGCATTACAGGCAAGCATGAAATGT 3121 AAAGTATTTATTTAAATAAAAAGAAAACCTCTAAATTGGTAATTGAATTACCTCCCTGTAGCTTTATAGTTTGTGACATT 3201 TCTTGACCTTGCTAGTTCTTTCATTAGATCTGCGCAAGATCTAGTCATCTGGTTAAGGATTTTAAGCAGATGCAACTATA 3281 AACCCAAGAAACTGTATTACTATTACTGTTGGTCATACTAAACCTGTCTATTTCCTGAAGTATATGACCCACAAGGATGT 3361 GGAATAACTAGGAGAAACTGTTTTTGTACACTGTACATCCTTAGTATTTTTACACGTATATGATAGGGATGAACATGATT 3441 TTCCTTCGTACAGACAGCTTAAATAAAGCACTATGTCAATCTGCTACTTCTCTGTTTATTGTTGTTGGATGTGGTTCTAT 3521 AATCCCCCCAAATTAAATCTTCTTTAATGAAAACATGATTTTTAATAGCCCCAGCTGGTATTAACCTACCTTGTATAAAA 3601 TGTGACAGGAAAATATAGAAATAATTCCTTGTAGCTCACACACACACACATAGGGGATCATTTTTACTTCAGTGAAATGG 3681 CAGTAGTGCGGTTGTGCAAACTTTGATGAACGGCTGCTTCTGAGGGGAAACGCTGACCTCTCAGCACTGGATTTAGGATG 3761 GATGTACTGTGAAGCCAGGGATGAAGGAGGTCTCAGACCCTGGGGACATTCAGACCCGAATCATCTATACAACACACGGT 3841 TTGGACCCAGAATCTGAAGGAATGTAGCTTTTCATTAACGTCTTCCTGATAATGTACTGCTCTGCATATTTCCTTTCTTA 3921 GAGTGTATTTCTAACAACATGTCATGGCAAATTAACAAACTTAGACGTGGGTGATGTAGATGGGTAGGATGGCTGGACTG 4001 CAGTCTGACTTCACGTTGAATCATTCTGGATGGGGCCTTTTTCTGATTTTACCTCATAAAGCTACTATTGTAGAAACTTG 4081 GCTTTGCTCCTGTGACGAAGCCAGACAGAGGAATGGCTTTTGGGACCAGAGTGAGTCAAGCATGTATGTGTATGTCACAC 4161 GGCCAAATTTGAGGGCATTCTCACATGTGCTCTTCTCTCAAAACCACTGGGGTTGACAGATCCAGGAGGCTAAAAAAAAG 4241 TGACCTCTATAATTCTTTAAAGGTGCTATTTTTAGAATATTGTATAATTTATTCACAGTATATCTAAAACAGAATTAAGG 4321 ACAATTAAAATATCTTATGTGACAGCCTTTATGTCTAGCACATTTGATGAAATAAAAAACTTCTGAATCTGAATAGAAGT 4401 TCTACTGTTTCAGGCTTGAACCTTTTACATGCTCAAGAGATTCAAATGGTCTCTGTGTGTAGATCATGCCACCGCCTCCA 4481 AAGCCTAATCCACATCACTTCTGAGAGGCAAGGCTGAGCATATGGTGACATCAGCTCTGTGTTGAGATGGTGATGAGGAT 4561 GATGGCTCGCTGGCCAGGCAGGGCAGCCGAAGGTCAGGGACCTGTCCTAACTAACTGCAGCCTTGCCTTTAGTGTTTGTC 4641 ATTCTCAGATACAACACGGTATGTCCAGTGTCCGTTTTTATTACTTTAAAGCATTTGAGGGCTTAATTGTGTATAGTAGA 4721 AATACTATTTTAGACAAATAATTATCTGTGTACAGATATTTGATATACTCTAAGTAAATTTTCTAATTTCACTAAGTACG 4801 TTTTTAGGCTCCTCTCAAATACTGCGTATTGAAGAAAAAAATCTGACACCACCGAGCCAAAGATGCTTTTTTGTCTGTTT 4881 TCGTTGTTTAACAGAATGGAAAGAGTAATGCATAGTGCTTCCTGGTGTCTCCTGATTGATTGATTGTGCACAAAGTAGGA 4961 CGATAAATAAATAAAATGGAGTCTGATGGGACATTGATTAAAGGTGAAGGATGATTGATATATAGATCATGAAAAGAAAA 5041 ATGAATGGCAGGAAAAAAAGTTTGGTCCTTAATATACTTTGGCCTAGTTAAAATATGTGCCTTTTTGGTGTGTTTTGTTC 5121 ATCACTACAAGATAAAAAGGAAACATTACAACTCAAGTCTTTAAAAAGTTCATTTATTGAAAATCATATGTATAACCTAG 5201 CATACGAATGAGCAGATTTAAACACATAACTTCAAGCCATTTCTGAAAACATACACCAGGAGCTCTGCTCAGCTAGAGTC 5281 AGACTCCAGCTCCAGCCCGACTGCGTGCGGGGACAGCGCCCGCGTTGATGAGGACCAGCCCCACTGCAGGCTGAGGCGGT 5361 GTCACCCTGGGAAGGTCGTGGTGCGTTGTGGCATATTAAGTCTAAACCAGATGAATGTAAATATCTCTTTGTAAATCATT 5441 TATTTCACTCTGTTCCATCCAGGTCAGCAATCAGATTGTGGCATGCTGGGTAACTGGAAAAAATAATAAAAAGTAAGTTT 5521 CAATAGCTCAAAAAAAAAA Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
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miRNA-target interactions (Predicted by miRanda) |
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DRVs in gene 3'UTRs |
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SNPs in gene 3'UTRs |
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Experimental Support 1 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Conditions | HEK293T |
Location of target site | 3'UTR |
Tools used in this research | miRanda |
Original Description (Extracted from the article) |
...
Verification of miR-122 target genes using 3'UTR reporter assay is shown in Supporting Table 4.
... - Tsai WC; Hsu PW; Lai TC; Chau GY; Lin CW; et al., 2009, Hepatology (Baltimore, Md.). |
Article |
- Tsai WC; Hsu PW; Lai TC; Chau GY; Lin CW; et al. - Hepatology (Baltimore, Md.), 2009
UNLABELLED: MicroRNAs (miRNAs), which are inhibitors of gene expression, participate in diverse biological functions and in carcinogenesis. In this study, we show that liver-specific microRNA-122 (miR-122) is significantly down-regulated in liver cancers with intrahepatic metastasis and negatively regulates tumorigenesis. Restoration of miR-122 in metastatic Mahlavu and SK-HEP-1 cells significantly reduced in vitro migration, invasion, and anchorage-independent growth as well as in vivo tumorigenesis, angiogenesis, and intrahepatic metastasis in an orthotopic liver cancer model. Because an inverse expression pattern is often present between an miRNA and its target genes, we used a computational approach and identified multiple miR-122 candidate target genes from two independent expression microarray datasets. Thirty-two target genes were empirically verified, and this group of genes was enriched with genes regulating cell movement, cell morphology, cell-cell signaling, and transcription. We further showed that one of the miR-122 targets, ADAM17 (a disintegrin and metalloprotease 17) is involved in metastasis. Silencing of ADAM17 resulted in a dramatic reduction of in vitro migration, invasion, in vivo tumorigenesis, angiogenesis, and local invasion in the livers of nude mice, which is similar to that which occurs with the restoration of miR-122. CONCLUSION: Our study suggests that miR-122, a tumor suppressor microRNA affecting hepatocellular carcinoma intrahepatic metastasis by angiogenesis suppression, exerts some of its action via regulation of ADAM17. Restoration of miR-122 has a far-reaching effect on the cell. Using the concomitant down-regulation of its targets, including ADAM17, a rational therapeutic strategy based on miR-122 may prove to be beneficial for patients with hepatocellular carcinoma.
LinkOut: [PMID: 19296470]
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Experimental Support 2 for Functional miRNA-Target Interaction | |
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miRNA:Target | ---- |
Validation Method |
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Article |
- Bai S; Nasser MW; Wang B; Hsu SH; Datta J; et al. - The Journal of biological chemistry, 2009
MicroRNAs are negative regulators of protein coding genes. The liver-specific microRNA-122 (miR-122) is frequently suppressed in primary hepatocellular carcinomas (HCCs). In situ hybridization demonstrated that miR-122 is abundantly expressed in hepatocytes but barely detectable in primary human HCCs. Ectopic expression of miR-122 in nonexpressing HepG2, Hep3B, and SK-Hep-1 cells reversed their tumorigenic properties such as growth, replication potential, clonogenic survival, anchorage-independent growth, migration, invasion, and tumor formation in nude mice. Further, miR-122-expressing HCC cells retained an epithelial phenotype that correlated with reduced Vimentin expression. ADAM10 (a distintegrin and metalloprotease family 10), serum response factor (SRF), and insulin-like growth factor 1 receptor (Igf1R) that promote tumorigenesis were validated as targets of miR-122 and were repressed by the microRNA. Conversely, depletion of the endogenous miR-122 in Huh-7 cells facilitated their tumorigenic properties with concomitant up-regulation of these targets. Expression of SRF or Igf1R partially reversed tumor suppressor function of miR-122. Further, miR-122 impeded angiogenic properties of endothelial cells in vitro. Notably, ADAM10, SRF, and Igf1R were up-regulated in primary human HCCs compared with the matching liver tissue. Co-labeling studies demonstrated exclusive localization of miR-122 in the benign livers, whereas SRF predominantly expressed in HCC. More importantly, growth and clonogenic survival of miR-122-expressing HCC cells were significantly reduced upon treatment with sorafenib, a multi-kinase inhibitor clinically effective against HCC. Collectively, these results suggest that the loss of multifunctional miR-122 contributes to the malignant phenotype of HCC cells, and miR-122 mimetic alone or in combination with anticancer drugs can be a promising therapeutic regimen against liver cancer.
LinkOut: [PMID: 19726678]
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MiRNA-Target Expression Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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MiRNA-Target Expression Profile (TCGA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Target | Description | Validation methods |
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Strong evidence | Less strong evidence | |||||||||||
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MIRT000012 | CYP7A1 | cytochrome P450 family 7 subfamily A member 1 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT000364 | IGF1R | insulin like growth factor 1 receptor | ![]() |
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4 | 3 | ||||
MIRT000365 | SRF | serum response factor | ![]() |
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4 | 1 | ||||
MIRT000663 | RAC1 | Rac family small GTPase 1 | ![]() |
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5 | 2 | |||
MIRT000717 | RHOA | ras homolog family member A | ![]() |
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2 | 2 | ||||||
MIRT003006 | CCNG1 | cyclin G1 | ![]() |
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4 | 4 | ||||
MIRT003079 | GTF2B | general transcription factor IIB | ![]() |
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2 | 1 | ||||||
MIRT003080 | GYS1 | glycogen synthase 1 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003081 | ANK2 | ankyrin 2 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003082 | NFATC2IP | nuclear factor of activated T-cells 2 interacting protein | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003083 | ENTPD4 | ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003084 | ANXA11 | annexin A11 | ![]() |
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4 | 2 | ||||
MIRT003085 | ALDOA | aldolase, fructose-bisphosphate A | ![]() |
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3 | 2 | |||||
MIRT003086 | RAB6B | RAB6B, member RAS oncogene family | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003087 | RAB11FIP1 | RAB11 family interacting protein 1 | ![]() |
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5 | 3 | |||
MIRT003088 | FOXP1 | forkhead box P1 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003089 | MECP2 | methyl-CpG binding protein 2 | ![]() |
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3 | 2 | |||||
MIRT003090 | NCAM1 | neural cell adhesion molecule 1 | ![]() |
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4 | 3 | ||||
MIRT003091 | UBAP2 | ubiquitin associated protein 2 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003092 | TBX19 | T-box 19 | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003093 | AACS | acetoacetyl-CoA synthetase | ![]() |
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3 | 1 | |||||
MIRT003094 | DUSP2 | dual specificity phosphata |