Gene Symbol
RAB21
Synonyms
-
Description
RAB21, member RAS oncogene family
Transcript
NM_014999
Expression
Putative miRNA Targets on RAB21
3'UTR of RAB21 (miRNA target sites are highlighted)
>RAB21|NM_014999|3'UTR
1 CT G TTCA CG C CT AAGAAATT A AAAGAC AGA AC A AA ACTG TGGA TCATTGC C C T CA AC AT G AAGACTGCC AT ATTCCA AG T
81 CAC ATT ATTTTA CC AAT G GAATTAT A GAATT AACAGTATTTTAAATTACG T TTA TAACA CT GCAGAGA CCTTA AGTGCT A
161 AA CTT A GTG G A GTT TGT GACCA GAGA ATTGGCATTTTCTACAA A T G T T TTTT TTT G T T TTTT TTTTG T T TT TTTTT G T T T
241 TTTTTTG A G ACG G AGTCT CG C TCTG T CAC CCA G GCTG GAGT GCA CT GGCT TGAT CTCG G CT CACTGCAAGC TCCAC C T CC
321 CAG GTTCACG C CATTCTCC TGCC T C AGCCTCCC G A GTAGCTG GGACTATA GG C G C C C ACCAC G ACG C CC G G C TAA T TTTT
401 TG TATT TTTAG TAGAGACG GGGTTTCACC A G G TTAG CCAGG A TGGTCTCGA TCTCCTG AC CT TGTGATCCG C CCG C CT CG
481 G C CTCC C A AAGTGCT GG GATTACA GG C G TGAGCCACCG T G C C C G G CCTAC AA A TGTTAACA AA GCAAT TACCAA T GGCCT
561 TTTTACAT AT TTTTTCTT TAAT G AGG AAT AATATG CATG TAGAAAA GACCT ACTTAAAGTCTTC AT TTATAT T CTTTCA A
641 A TCAA ATCT TTAT TTAATAACT TATAT AT G TTGTTGGAATG GT TACAT TTTTGCAG C C CTTTGTATTTTGT GG TAGT TGA
721 A ATT GTAT CA C TTCT AA ACAGCA AACTGTTTTTGTTTTTA AT TAGCA G ATATC TGA AGTACTATTTTTGC AGGGTT TGC A
801 CAGGCCCG T A ACTG TCTACT ACTTTGATAT A ATCTGTAT AC ATCCTGT ATGCTGAGCT GGT AAAATAC A TT GTAAATTAC
881 A T ATT AAATATTTTA TCTGCTTTT ACAAGCG C AA G GTGC AA AAATAT A T AC AA T AGTCT C A TT GATGACTGTAAA GTGAA
961 TTAACATTTGGTGAT TATGCCTAG C TTTT TTG A CT A A TATA AA GAT C ATAGCTCCCCTTCAC T TCTGT CTTAACTTGAAC
1041 ATGGCG T G TTTAAATTTTCATACA TAC TTTACTTGAATTATTGCTG T TG TCACATATTTTTGCCTCTGTGAGTTCATCTG
1121 ATGATTGAGCAGTAGCATTTGCCTTTTGGGTTTTTTGTTTGTTATTATAGAAGAGATGACTTCTGCTGATTTTGCTTTAG
1201 AATGGTTACCTTAGAAGAATTTGGGTGGCTCATGTTGAATTTCACTTCTGCAATAGCTTTCATTTTCTCATAGGCTTTAT
1281 AAGAGATGGGTTCAGTGGTATGAGCAGAGGAAGAGATCCCAGATAGTAGCCAGTTAACCAAGACTCATTCATATAGCACG
1361 TAGTTTATGTTCCTGAGGCAGCACTTTTAGATCCTTTGTGAGCAAGTTCTATTTGTTCATTGCTTGCCAGAGATGAACAC
1441 AGAATGTTCTGTTTCATTTTACAAGAACTATCCTGAGTTTCTGTGGATGGAAACATTACATGTAATGCAGATATAGTGAA
1521 CACTGGAAAGATTTATTAAAGAATTATATTTGTGTATACTTTATAAATTAGTCCCTCATTAGATTTTTTTTTCTTAAGCA
1601 TAAGACTGAACTTAAATGTGTTAATTTTAGTAGAATCAGGCACTGCTCGCAGAAGGAACACAGATTGTAGAGATTAACAT
1681 AAATTGTTCTTGTTCTAATATATATATTTTTTCATTTCTGTCGTGCTTGGAAAACTAGTAAATATTATGTCTAAGATAAA
1761 ATGGAATGGCCCCTGGATTTACTTCTTATAAGAAGCAGTAGTATGTAATAAAGCTATTAGCATGAGCAATTAAGAGGCTA
1841 TAAAGAGATTATAGTTACAAAAGAAATACTGCCATATTTTTAAGTTAATAACTTAAACCTTCTCAAATGGGTTAAAAGTT
1921 GAATGAATTGACACCCTGATGTTATGATGTTGGAATTTTAACTTAAACTGGGAGGCATTCTGTGAGCCTTCACTTTACCT
2001 TCTTTAATTATTGTCCTTGCTAAACTCAACACAGACTTTTCTGTTATGTGTTTTTGAGGAAGTTGGGGTGGGAAGAGTCA
2081 GGGAGATAAGCTAAAATTGTCTTCTTTTATGGGGTAATTGTACTCTGTAGTCTCTTGGTTTCCTGTGAAGTTAGTATTTA
2161 TGTGGGGGTGGGGGAAGGTAGCAAGAATCATGGGTATCACGGTACTTTGTTTTTGACCTCCTGGCTCTTTCAGACAGAGT
2241 GAAGAAAGCTTTTCCATTCTTACTGTTGTAGAAGTAGATAGGAAATAAGCTTTTCTCATTACAGTGAAATATGTTTTAAA
2321 AACTAGAGTAGCTGGGCACAGAGGCATGCATTTGTAGGGCCAGCTACTTGGGAGAGTGAGGCAGGAGGATCACTTGAGGC
2401 CAGGATTTCAAATCCAGCCTAGGTAACACTGAGACCTCCATCTCGTAAAAGGCACAAAAACTAGTTAGAGATGAAATTGA
2481 GCTTTATTTTAAAAAAACGTTCTAAAGCCTGATAATTGGAGAGCTATACTTCAGCTTTTCATCCTACTTTAATGAAACAG
2561 CTAGATAGGAACCTCTGCTCCAGAATTGCCAGATAATTATTGGTGGGTCATAACTATTCTTCATATTTTTTTTTTCTTTT
2641 TTCTCCTTTGGTTTCTGTGTTATCTTTCTTAACCTCACGTATTTCTTTATCCTTTTTAGTGGGGGCCTGTAATTGAGGCT
2721 AATTCAATAGCAACAATAGACAACATGATATGGCTGCTG TCACTTTGAAACCCAAAAGGTCTTTGGGTAGGAATAGAGTA
2801 ATGAAAGAGGACCAGTCAACTTCAGTATATATACAAAGGAAAGACAAAGAGATGATAAACCAAGGCTGAGGAAATTTTTC
2881 TGATGCTTTCTTCATTTCTCTAATATACCTTTTGCATTCTTTTTCTGATAATTGTGCTATTAGGCAGAAGACACAAGTTA
2961 CCACGTTGTGTATTAAAAGCAGTAGGTAGGTTGTGCCAGTATTTTTTCAGCCAGTAAGCATATACAGTTAACTTATATAA
3041 TTAAAAATTGGTTTAAGATAGTGATTAAAAATACCTGAATATTATGTTAAAAGTATACAATCATTGTTTCTGTAATGATG
3121 ATGGGTATTCTGCTTCTTGTTTTTCATTGTAATTACAGGGGAAGATTGTTTTTGAAAATGTATATTGCCATGCTTTTGGG
3201 GTAAGCAGTAATGTGAAAAGAAAAAAGCATTATGTTATTGTATGAAATATAAGTGTTCAGATTTGTTTTGTCTGGGGTGT
3281 TGCCTAAGAATACCCTAAAGCTATGGCTGTTACTGCATTGAAATCTTTTTTTTTTTTAATAGTAGCCATATGTTATTAGT
3361 GGAGTACTTTATATTTGACATTAAAGTGAAGAAGAAGAGTAGTACTTCACTTTTAGGTTTTTAGTAGTGAAAGATAAAAT
3441 TGGAAAAATAGGGAAAGAGCATAGGGAGGAATAGAATGGAAGTCAAGTAAATAAAAAACTACAACCTGACAGTTTTTTAA
3521 ATCACTTTGAAAAGTACATTACTTTTATCAAAGAGTTTCTAATTAAGGCAAACTATGCATTATGCCAAATATTAAGAACA
3601 TTTTAAAAATGGATTGTGATACTGTTTATTTCTTTAATTATATAATTTGCAATTTTCTGTATTATAAGTGCTACCAGGAT
3681 TCTAGATAGTTGATCTTACATATTCAGATAGTATAGTTTACTCTTATAATTACCCGTTACGTTATCTCTAAAAGTAGTTT
3761 GATCTGTGCCTTTAACTTTTAGAATTCATCTTTTGACTTGTTTGCCACTGTAGAGTTTTCAGTTTTCTCTGTAGATTCAG
3841 TGTGACAAAGAGGGAATACATAATTTGTGACCATTTAAGATGCTGATATTTTCTGGAAAAGGATATAGATAGTAGTAGTG
3921 ACCCGCAGGAGCCTCACAATAATGTCTAAAGATATAAACTGAGTAGATCCCTAAGTACTCTTCTCTAAATTATAAAATGC
4001 ATTACCTAGGCTTTAATAGTTAAAAGCTGGAATTTATTGAACCGCATCTACTTGATTTCATAATATGCATTGATTTTAGT
4081 ATGTTGCTGTTC TGTTATCTGTAATCAACTATAACAGAGTAATATATTTGGTGTTCTGGACCAAAATTCGTGCTACACAT
4161 ATGTCTGATGGCCTTTACCTTTTCAAGAAAACAGTTGCAATTTTGAGCAAAATTTTCCTAGTTGTAATATTTTAATAGTG
4241 TTATGTATTGGAAAAAATTTAGAAATACTCCTAAGAGTTTTCAATTTCAAGCAGAAATGCTTCTCTTCTAAATAAATACC
4321 ACTTAATTGATAGACCTTTAGCAGTTCTTGTGCTATCTAGGATTTATACATTTTTGCTTTTCTGGAAAACTGCTTTGGCG
4401 CATTAACCTTTCTACTGCAACATTTTCTCTTCAGTAGATATATGAGTAAACATGATGAGTTAATGTTACACAGCATACCC
4481 AGTTAGGTCTCTTATTCTTAAAGCATCTTTCTTTAGAAGTCTGCACATATTTTCAAATGCATCATATTAAAGGCACAAGT
4561 CAAGAGGAGGTGGAGTTGCCTACTTCAGTGGCCTTTATTCCCACTATACCAGTTCTCAGTCTTGATTTTGATACTTTCTG
4641 GCAACTGTATCATCTCTTCACTATCACGTATTTTAAGAAAAAGCTAAGGTGATTTCTTTACATTTGAACATGTGTAGATC
4721 AATGAGAGAATGGTGAGGGATAGCAAGGATAAAGTATAATGTTGAAAAGTAGAAAGAAGTGGTATCTGCTAAACTCTAGC
4801 TTTAGTAGCAAGCTATTTTAAGGAAATCATTGTATGTGGTACTTCCTAGAAATATGAAAGTTCCTCATTTTGTATTTAAT
4881 TATGTAAGAAAATGTTCTAGGAAAAGAATAAAAAACATATATTGTCAAAGTGCCCTTTGGTAGTGCTCCCAAATGGTAGT
4961 AACTATTGGTCTCTAGTATATACTCCTCAAATATCTTTTTGCTATGTATTAATATATCTATATGTTTACATATAGAAATA
5041 CATAGTGTTGTGGGTTTTAAATTTTCACATAAATTGTGTCTTACCCATGTGTTTTGCCATTTGCCTTTTCTCTTGCCAAC
5121 GTGTCTAGGAGCTCTTTGGTAAATACAGACTTTTTCATTTTATTTCCTCCCACATTTCTATGGATGTGTCTTGCCTTTTT
5201 CTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTCTTTTTTAAAATAGCCTCTGACTCCATGAAACCTGAAAAGGAATCTGGTCTGTTAGG
5281 TGGATTTCATTAGTATCCAAATTTATTTATTTTTTTATTTCATTTTTTTGAGACAGTCTCGCTGTGTCACCCAGGCTGGA
5361 GTGTGGTGGCTCAGTGATAGTTCACTGCATCCTTGAACTCATGGACTCAAGCAATCCTCTTGCCTCAGCCTTCTGAGTAG
5441 CTGGGACTACATGTGTAAGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTCATTTTTAGTAGAGATGGGAAGTCTTGCTGT
5521 GTTGCCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGGCCTCAACCATTCCTCCCACTTCAGCCTCCCAAAGTACTGAGATTACAGATGT
5601 GAGCCACTAGGCCCAGTCAGTATCATAGAATTTAAATGCAAGCCAATGCTTAGACAGAATCAGGGTCTGCTTTAAGCATG
5681 TGAATCAGGAAACTAGAAGGCCTCTTGTAATGTATTTGAAGTTCATTACTTTTGGCTGACGGTTGACTGCTTAGTGTATA
5761 AAATCTAGGAGTTAACTTTAGCAGATTCTTTTATCAGAATACGTTTTTTATTGGAGGGAAGAAGGAAAAAGAGGAAAGGT
5841 ATAACTGATGGGGAAAAGTACAAGATAAACTAAAACAAGTCTTTATACAACTCTGACAGCAACTCCCATAACAGGACATG
5921 ATGCTACCAAAAATTCAAACTTGTATTTGATCTGTGCCTTTAATATAGAGTAAAAACAAAAGTTCCTTTTTAGATCTCCC
6001 TTCCCTCATCATCCCACATCCCTTTTTAGAGGTAACCATTGTTAACAGTTTGGTTTGTGTCTTTATTATGCAGTTTTATA
6081 TTTATATTTGGCCTTTGTAAATTTTCCATTCCCTGAATGGAACTTCTACCCTATATCAAATTCCACCCTCAACTGACCAA
6161 TTTACCAAGGCCAACTAGAATCATACTTCTTTTTCTGGAAGTTTTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTTTGCCGCACAGACTA
6241 GAATGCAGTAGCATGATCATAGCTCATTGCAGCCTCAAACTCCTGGGCTTAAGCAATCCTCCCACCTCAGACTTCGAAGT
6321 AGCTGGTATTACAGGTGCATAACACCACCACCCACGCCTGGCTAATTGTTTTGTTTTTTTTGTGGAGATGGCTCTCACTT
6401 TGTTGCCCAGGCTGGTTTTTGAACTAGTTTCAAAGTGATCCTCCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTACTAGGATAACAGTCAT
6481 GAGCCACCATGCCCACCCTAGAATCATACTCTTTTAAAGCAAGTTAAATCAGCAGTAATAGTTCTGGAACTAGAAGTTAA
6561 CTACTTACTGGACTTTTGAGATGTAAGTTTACCATACATCAAGCTTAAAAACTTGTAGCGTTCTGGGAAAGTCAAGTCAA
6641 ACTCTTGAATGCTATCCTCTGTGGAAATAGGGTTGGGAAAGAGCAATGTACAAGTCCAAGCTCCTTAATACACATAAAAC
6721 TCTGGGTTGGGCTCATCCTCTTGGTGTATTTTCCTACTTGGAGAGCATTACAGTGTCCAACAATTTATAGGAGCTTCTCT
6801 GCACTGTCAAGACTATAGCTTAGCATATGTGTGCTATGACACAAGGTTAAACGTGTGCCCCAGAACAAATGCATTTATTC
6881 ATGTTTGACTTTAAATGAAAATTCAGAAAGCAGGTTAAGCATATATGTGAGTTTAATAATTGTTTCTGTATTTTAAAAAA
6961 TTTTAAAACATTCAGCTTTTTATGACTTTGGTTAGTTTCACTCATTTGTTGAGTGCCTTCTGTATGCCCAGTGCACAAAC
7041 TGCTATGTGCCCAGTGTACATACATGGGAGAACCAGATAGCCAAAGTGCCTTCCTTTATCGTTGGAACCTAGAGATGAGC
7121 TGATACCTGTTGCACATAGTCCAAGATATAAGTAATTTATCTGGGGATATAAGGTCACCTGTGCACACATGTTCACATTC
7201 TGTGTTTGATCAGATATGTACCTGCCAAACTTTTGGAGTGAGATAATTAGAATGACAGTAGTTGAAGCTGACAGTGAATT
7281 TGAGGTAAAGCTGGAAAGAATGTTTTTGAATTTTGCAAATAATACATTTTCAAGCCAGATTAAAATTGAATAACTTACTT
7361 TCTAGCTTCAAGGGGGTAATTAAGTGATCCTCTAACCCAAATTGCTTTTCCAAATTTTGTGGTAGCAGTGAATAAACTGA
7441 TGCCTCCTGCTTATTTAGACAGCAGCCATTTTTGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTGCGGTGATTTTTTTTAACCTAGAAAAA
7521 ATACAATTTAAAAAGCAATCATGTTGTTTTCTTTGCCTTTGACAGATGTGGCCTTGTCACCACACAGTAAGCCAGAACAC
7601 AATCCATTCCTGAGTCATAGTAGGATAGTTTGTGTAATTCTAAATGCACTCTCCAGTTTAAGAGTGTGGGTCCCTTTTTT
7681 TCTATCTGAAATTGAAGATACAGGTCAGAAAGATGGTTTAATGAATATGAATTTTCTAAACATCTTTTCAGTGTCTTTTA
7761 AGGATATTTTTGATATTACAATATAATAAAGTTAAATCATCTA
Target sites
Provided by authors
Predicted by miRanda
DRVs
SNPs
DRVs & SNPs
miRNA-target interactions (Predicted by miRanda)
ID Duplex structure Position Score MFE
1
miRNA 3' guguuuggUAAUACACGACGAu 5'
||||| |||||:|
Target 5' ttacttgaATTAT-TGCTGTTg 3'
1069 - 1089
141.00
-10.70
2
miRNA 3' guguuuGGUAAUAC-ACGACGAu 5'
::| |||| |||||:|
Target 5' ttgattTTAGTATGTTGCTGTTc 3'
4070 - 4092
140.00
-9.20
3
miRNA 3' guGUUUG--GUAAUACA-CGACGAu 5'
:|:|| ||| || | ||||||
Target 5' aaTAGACAACATGATATGGCTGCTg 3'
2735 - 2759
134.00
-15.50
DRVs in gene 3'UTRs
SNPs in gene 3'UTRs